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El estudio de sistemas biológicos, debe considerar como enfoque primario el análisis y descripción de la estructura de la comunidad, así como el estado de las poblaciones a diferentes escalas, mediante el cálculo de índices ecológicos, poblacionales y genéticos, así como su interrelación para determinar la dinámica de poblaciones y comunidades presentes en un ecosistema dado. Para ello, se desarrollan las siguientes líneas de trabajo:
